Klordioksit dünyada 50 yılı aşkın süredir alkolsüz dezenfektan olarak kullanılan bir oksidandır. Mantarlar, algler, mikroplar ve virüsler gibi zararlı mikroorganizmaların moleküler bağlarını zayıflatarak yok edilmesinde oldukça etkili olmasıyla bilinir.
Yapısında bulunan 2 oksijen atomu sayesinde güçlü bir oksidan olan klordioksit ölen bakteri ve virüsü yakar, böylece ardında kalıntı bırakmaz. Bu nedenle ortamda kötü koku oluşumunu da önler.