Özellikle enfekte olmuş meyvelerden kaynaklanan çok sayıda patojen sporunu etkisiz hale getirmek için kullanılan klordioksit, sisleme şeklinde uygulamalar ile meyve ve paketleme evinin havasını sterilize etmesinin yanı sıra, aynı zamanda meyve işleme hatları ve meyve kasalarının yüzeylerinde bulunan patojen mikroorganizmaları da elimine eder.
Böylece meyve ve sebzelerin tazelik özelliği daha uzun süre muhafaza edilir ve raf ömürleri uzatılır.
Bununla birlikte, Süt Sağım ve İşleme Tesislerinde, Et-Tavuk Kesimhanelerinde ortam ve ekipman dezenfektanı olarak kullanılır. Ayrıca Balık yetiştiriciliğinde kullanımı sonucu balık ölümlerini minimize ederek, kötü koku oluşumunun da önüne geçer.